期刊简介

               本刊是由广西医科大学主办的国内外公开发行的医学学术期刊。内容丰富,形式多样,科学性强,有实用性。主要设有论著、经验交流、调查研究、技术与方法、护理园地、病例报告等栏目。                

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  • 杂志名称:广西医科大学学报杂志
  • 主管单位:广西医科大学
  • 主办单位:广西医科大学
  • 国际刊号:1005-930X
  • 国内刊号:45-1211/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:全国高校自然科学优秀学报期刊收录:知网收录(中), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 万方收录(中)
广西医科大学学报杂志2013年第06期

蛇毒Ⅰ型和Ⅱ型磷脂酶A2基因密码使用的比较和分析

淳于柳爽;史晓雄;陶廷婷;梁宁生

关键词:磷脂酶A2基因, 密码子, 同义密码偏好性, 蛇毒
摘要:目的:通过比较和分析蛇毒中Ⅰ型和Ⅱ型磷脂酶A2(phospholipase A2,PLA2)基因编码的特点,了解蛇毒中两类PLA2分子生物学的信息.方法:从国际基因库中搜寻所有蛇毒PLA2基因信息(mRNA),对于符合研究条件的基因,利用CodonW分析软件和计算机进行分析,计算出两类PLA2的同义密码相对运用值(Relative Synonymous Codon Usage,RSCU),编码区鸟嘌呤/胞嘧啶(GC)含量和GC在三联体密码子中第3位置上所占的百分比(GC3S)含量,以及4种类型的碱基的含量.结果:眼镜蛇科Ⅰ型PLA2和蝰蛇科Ⅱ型PLA2基因编码区GC含量明显不同,蝰蛇科Ⅱ型PLA2的GC含量和GC3S含量分别为53.05%和65.53%,明显高于眼镜蛇科的Ⅰ型PLA2的49.48%和49.68%;RSCU值显示眼镜蛇科Ⅰ型PLA2对29个密码子具有偏好性,蝰蛇科Ⅱ型的有27个密码子,两类PLA2偏好使用的密码有明显不同;蝰蛇科Ⅱ型PLA2的RSCU相对较高;在可以选择密码子的19个氨基酸中,两类PLA2在12个氨基酸有着不同的偏好性;终止密码子具有特殊的偏好性,RSCU值均很高.结论:眼镜蛇科和蝰蛇科的两类PLA2基因在密码子使用上有明显不同的偏好性,蝰蛇科的PLA2偏好程度更强些,这可能与蝰蛇科的PLA2基因位于GC丰富的区域有关.